研究院党支部是党的基础组织，担负直接教育党员、管理党员、监督党员和组织群众、宣传群众、凝聚群众、服务群众的职责，发挥着承上启下、联系左右、沟通内外的枢纽作用，协同服务教学、科研、管理、服务等机构。
经学校组织部和梅山机关党委协商，按照属地管理的原则，于2019年5月成立中共北京航空航天大学宁波创新研究院支部委员会，现有党员42名。9月3日获批梅山党工委对支部委员会任命，成立第一届党支部委员会，何莎同志任书记。8月19日召开首次党员大会。
2019年9月，党支部联合学校派驻师生共同开展“不忘初心、牢记使命”主题教育。
2020年响应梅山党工委号召，建立“周二夜学”制度。
2020年7月14日召开党员大会进行新一届党支部委员会选举，经中共宁波市委梅山保税港区工作委员会直属机关委员会批复，何莎同志任书记，虞刚刚同志任副书记，戴雨田同志任组织委员，赵琪同志任宣传委员，王怡文同志任纪检委员。
2021年4月印发《中共北京航空航天大学宁波创新研究院支部委员会关于开展党史学习教育的实施方案》，积极开展党史学习教育。
2022年大力开展“北航蓝 党旗红，铸造科创先锋”党建服务品牌创建活动。
